Création et utilisation de chimiothèques optimisées pour la recherche in silico de nouveaux composés bioactifs
Les tests de criblages, qu ils soient réels ou virtuels, permettent d explorer des espaces chimiques donnés afin d identifier de nouveaux principes actifs potentiels. Le choix des molécules à tester joue un rôle essentiel dans le succès d un criblage. Les deux étapes importantes dans la préparation...
Enregistré dans:
| Auteur principal: | |
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| Format: | Thèse numérique |
| Langue: | Français |
| Publié: |
Villeurbanne :
[CCSD]
2007.
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| Sujets: | |
| Accès en ligne: | Accès au texte intégral Accès Université d'Orléans |
| Note: |
Description d'après la consultation, 2018-04-26 Titre provenant de l'écran titre Cette édition peut différer de la version de soutenance enregistrée sous le Numéro National de Thèse : 2006ORLE2064 Thèses CCSD |
| Autres localisations: | Voir dans le Sudoc |
| Variante du titre: | Design and use of optimized chemical databases for in silico research of new bioactive compounds |
| Edition sous un autre format: | • Création et utilisation de chimiothèques optimisées pour la recherche in silico de nouveaux composés bioactifs, par Aurélien Monge, [S.l.], [s.n.], 2006, 1 vol. (185 p.) |
| Résumé: | Les tests de criblages, qu ils soient réels ou virtuels, permettent d explorer des espaces chimiques donnés afin d identifier de nouveaux principes actifs potentiels. Le choix des molécules à tester joue un rôle essentiel dans le succès d un criblage. Les deux étapes importantes dans la préparation des molécules pour le criblage sont le choix, pour un test de criblage donné, de l ensemble des molécules à considérer et la sélection, au sein de cet ensemble, des molécules pertinentes. Idéalement la préparation des composés destinés au criblage devrait se faire grâce à un logiciel dédié à cette problématique. Il n existe cependant aucun logiciel qui soit complètement adapté. Nous avons donc entrepris le développement d un logiciel de ce type : ScreeningAssistant. Ce logiciel s appuie sur un système de gestion de bases de données et permet de créer et de maintenir à jour des chimiothèques de plusieurs millions de molécules uniques provenant de fournisseurs différents. Il permet également de filtrer les structures, en éliminant les molécules potentiellement problématiques ou avec des probabilités d activités faibles, et de sélectionner un ensemble de composés divers. Des analyses graphiques automatiques sont également disponibles. Ce logiciel a été utilisé pour l analyse d une base de 5 millions de références provenant de 38 fournisseurs de produits chimiques. La proportion de composés uniques, originaux, drug-like , lead-like , et divers ont été comparés. La diversité a été étudiée en utilisant des notions différentes, et un score de diversité globale, prenant en compte la diversité suivant les différents critères, a été proposé. Différentes applications de sélection de composés pour le criblage sont présentées. Ces applications utilisent le programme ScreeningAssistant et d autres algorithmes développés pour résoudre certains problèmes particuliers. |
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| Description: | Description d'après la consultation, 2018-04-26 Titre provenant de l'écran titre Cette édition peut différer de la version de soutenance enregistrée sous le Numéro National de Thèse : 2006ORLE2064 Thèses CCSD |
| Format: | Un logiciel capable de lire un fichier au format PDF |