Création et utilisation de chimiothèques optimisées pour la recherche in silico de nouveaux composés bioactifs

Les tests de criblages, qu ils soient réels ou virtuels, permettent d explorer des espaces chimiques donnés afin d identifier de nouveaux principes actifs potentiels. Le choix des molécules à tester joue un rôle essentiel dans le succès d un criblage. Les deux étapes importantes dans la préparation...

সম্পূর্ণ বিবরণ

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গ্রন্থ-পঞ্জীর বিবরন
প্রধান লেখক: Monge, Aurélien, 1979-
অন্যান্য লেখক: Morin-Allory, Luc (Thesis advisor)
বিন্যাস: Thèse et Mémoire papier
ভাষা:Français
প্রকাশিত: [S.l.] : [s.n.] 2006.
বিষয়গুলি:
টীকা: Publication autorisée par le jury
Autres localisations: Voir dans le Sudoc
Variante du titre:Design and use of optimized chemical databases for in silico research of new bioactive compounds
Edition sous un autre format:• Création et utilisation de chimiothèques optimisées pour la recherche in silico de nouveaux composés bioactifs, par Aurélien Monge, Villeurbanne, [CCSD], 2007
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245 1 0 |a Création et utilisation de chimiothèques optimisées pour la recherche in silico de nouveaux composés bioactifs   |c par Aurélien Monge ; [sous la direction de] M. Luc Morin-Allory,... 
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500 |a Publication autorisée par le jury 
502 |a Thèse de doctorat. Chimie informatique et théorique. Orléans. 2006 
504 |a Notes bibliogr. 
520 |a Les tests de criblages, qu ils soient réels ou virtuels, permettent d explorer des espaces chimiques donnés afin d identifier de nouveaux principes actifs potentiels. Le choix des molécules à tester joue un rôle essentiel dans le succès d un criblage. Les deux étapes importantes dans la préparation des molécules pour le criblage sont le choix, pour un test de criblage donné, de l ensemble des molécules à considérer et la sélection, au sein de cet ensemble, des molécules pertinentes. Idéalement la préparation des composés destinés au criblage devrait se faire grâce à un logiciel dédié à cette problématique. Il n existe cependant aucun logiciel qui soit complètement adapté. Nous avons donc entrepris le développement d un logiciel de ce type : ScreeningAssistant. Ce logiciel s appuie sur un système de gestion de bases de données et permet de créer et de maintenir à jour des chimiothèques de plusieurs millions de molécules uniques provenant de fournisseurs différents. Il permet également de filtrer les structures, en éliminant les molécules potentiellement problématiques ou avec des probabilités d activités faibles, et de sélectionner un ensemble de composés divers. Des analyses graphiques automatiques sont également disponibles. Ce logiciel a été utilisé pour l analyse d une base de 5 millions de références provenant de 38 fournisseurs de produits chimiques. La proportion de composés uniques, originaux, drug-like , lead-like , et divers ont été comparés. La diversité a été étudiée en utilisant des notions différentes, et un score de diversité globale, prenant en compte la diversité suivant les différents critères, a été proposé. Différentes applications de sélection de composés pour le criblage sont présentées. Ces applications utilisent le programme ScreeningAssistant et d autres algorithmes développés pour résoudre certains problèmes particuliers. 
650 |a Biomolécules actives 
650 |a Chimie  |x Logiciels 
650 |a Chimie  |x Informatique 
650 |a Criblage pharmacologique 
650 |a Thèses et écrits académiques 
700 1 |a Morin-Allory, Luc.  |4 ths 
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787 0 8 |i Reproduced as:  |0 247020478  |t Création et utilisation de chimiothèques optimisées pour la recherche in silico de nouveaux composés bioactifs  |f par Aurélien Monge  |c Lille  |n Atelier national de reproduction des thèses  |d 2006  |p Microfiches  |s Lille-Thèses 
997 |0 251773  |1 Thèse et Mémoire papier  |a Ressource papier  |c 0/Orléans/  |c 1/Orléans/BU Sciences, Technologies, STAPS/  |z Orléans, BU Sciences, Technologies, STAPS, TS 19-2006-64  |z Orléans, BU Sciences, Technologies, STAPS, TS 19-2006-64 b