Création et utilisation de chimiothèques optimisées pour la recherche in silico de nouveaux composés bioactifs
Les tests de criblages, qu ils soient réels ou virtuels, permettent d explorer des espaces chimiques donnés afin d identifier de nouveaux principes actifs potentiels. Le choix des molécules à tester joue un rôle essentiel dans le succès d un criblage. Les deux étapes importantes dans la préparation...
Wedi'i Gadw mewn:
| Prif Awdur: | |
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| Awduron Eraill: | |
| Fformat: | Thèse et Mémoire papier |
| Iaith: | Français |
| Cyhoeddwyd: |
[S.l.] :
[s.n.]
2006.
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| Pynciau: | |
| Nodyn: |
Publication autorisée par le jury |
| Autres localisations: | Voir dans le Sudoc |
| Variante du titre: | Design and use of optimized chemical databases for in silico research of new bioactive compounds |
| Edition sous un autre format: | • Création et utilisation de chimiothèques optimisées pour la recherche in silico de nouveaux composés bioactifs, par Aurélien Monge, Villeurbanne, [CCSD], 2007 |
| Crynodeb: | Les tests de criblages, qu ils soient réels ou virtuels, permettent d explorer des espaces chimiques donnés afin d identifier de nouveaux principes actifs potentiels. Le choix des molécules à tester joue un rôle essentiel dans le succès d un criblage. Les deux étapes importantes dans la préparation des molécules pour le criblage sont le choix, pour un test de criblage donné, de l ensemble des molécules à considérer et la sélection, au sein de cet ensemble, des molécules pertinentes. Idéalement la préparation des composés destinés au criblage devrait se faire grâce à un logiciel dédié à cette problématique. Il n existe cependant aucun logiciel qui soit complètement adapté. Nous avons donc entrepris le développement d un logiciel de ce type : ScreeningAssistant. Ce logiciel s appuie sur un système de gestion de bases de données et permet de créer et de maintenir à jour des chimiothèques de plusieurs millions de molécules uniques provenant de fournisseurs différents. Il permet également de filtrer les structures, en éliminant les molécules potentiellement problématiques ou avec des probabilités d activités faibles, et de sélectionner un ensemble de composés divers. Des analyses graphiques automatiques sont également disponibles. Ce logiciel a été utilisé pour l analyse d une base de 5 millions de références provenant de 38 fournisseurs de produits chimiques. La proportion de composés uniques, originaux, drug-like , lead-like , et divers ont été comparés. La diversité a été étudiée en utilisant des notions différentes, et un score de diversité globale, prenant en compte la diversité suivant les différents critères, a été proposé. Différentes applications de sélection de composés pour le criblage sont présentées. Ces applications utilisent le programme ScreeningAssistant et d autres algorithmes développés pour résoudre certains problèmes particuliers. |
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| Disgrifiad o'r Eitem: | Publication autorisée par le jury |
| Disgrifiad Corfforoll: | 1 vol. (185 p.) : ill. en noir et en coul. ; 30 cm. |
| Llyfryddiaeth: | Notes bibliogr. |