Etude par simulation de dynamique moléculaire de la variabilité conformationnelle du dimère de la séquence SL1 du génome de VIH-1
Le génome du VIH-1, l'agent responsable du SIDA, est composé de deux molécules identiques d'ARN liées de façon non-covalente par une région de leur extrémité 5'. Il a été montré que la tige-boucle SL1, localisée dans cette région, était capable d'initier cette dimérisation. La di...
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| Altres autors: | , , , , |
| Format: | Thèse et Mémoire papier |
| Idioma: | Français |
| Publicat: |
2004.
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| Nota: |
Autres contributions : Jacques Paoletti (président du jury), Luc Morin-Allory (membre du jury), Mahmoud Ghomi et Richard Lavery (rapporteurs) |
| Autres localisations: | Voir dans le Sudoc |
| Variante du titre: | Conformational variability of the dimer of the SL1 sequence from the genomic RNA of HIV-1 :, a molecular dynamics simulation study |
| Edition sous un autre format: | • Etude par simulation de dynamique moléculaire de la variabilité conformationnelle du dimère de la séquence SL1 du génome de VIH-1, par Samia Aci, 2005, Villeurbanne, [CCSD] |
| Sumari: | Le génome du VIH-1, l'agent responsable du SIDA, est composé de deux molécules identiques d'ARN liées de façon non-covalente par une région de leur extrémité 5'. Il a été montré que la tige-boucle SL1, localisée dans cette région, était capable d'initier cette dimérisation. La dimérisation constitue une étape clé du cycle de réplication du virus et fait intervenir deux types de complexe de SL1 : un kissing-complex et un complexe en forme de double hélice contenant deux boucles internes. Plusieurs structures contradictoires ont été publiées pour ces deux complexe, et différents mécanismes de transition entre ces complexes ont été envisagés jusque là. Ce travail a permis d'étudier la stabilité des différentes structures publiées, et en particulier de faire ressortir de l'ensemble des structures de kissing-complex publiées une conformation plus probable. Parallèlement, l'étude du mécanisme de transition a mis en évidence une structure intermédiaire dans ce processus. Ce travail constitue un ensemble d'informations qui pourra par la suite être utilisé pour la conceptions d'inhibiteurs de la dimérisation. |
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| Descripció de l’ítem: | Autres contributions : Jacques Paoletti (président du jury), Luc Morin-Allory (membre du jury), Mahmoud Ghomi et Richard Lavery (rapporteurs) |
| Descripció física: | 1 vol. (183 f.) : ill. en noir et en coul. ; 30 cm. |
| Bibliografia: | Bibliogr. f. 174-183 |
| Accés: | Publication autorisée par le jury |