Interaction entre yOgg1, une ADN glycosylase de la voie BER, et l'ADN polymérase réplicative Pol chez Saccharomyces cerevisiae
Les dommages oxydatifs de l ADN sont impliqués dans les processus pathologiques que sont le cancer, les maladies neurodégénératives ou le vieillissement. Ces dommages résultent en partie de l action des espèces réactives de l oxygène (ERO), qui proviennent du métabolisme cellulaire ou d agents exogè...
保存先:
| 第一著者: | |
|---|---|
| その他の著者: | |
| フォーマット: | Thèse numérique |
| 言語: | Français |
| 出版事項: |
2013.
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| 主題: | |
| オンライン･アクセス: | Accès au texte intégral https://theses.univ-orleans.fr/public/2013ORLE2077_vm.pdf http://www.theses.fr/2013ORLE2077/abes https://theses.hal.science/tel-01145247 |
| 注記: |
Titre provenant de l'écran-titre Ecole(s) Doctorale(s) : École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire ; 2012-....) Partenaire(s) de recherche : Centre de biophysique moléculaire (Orléans ; 1967-....) (Laboratoire) Autre(s) contribution(s) : Alain Legrand (Président du jury) ; Bertrand Castaing, Alain Legrand, Evelyne Sage, Juan Pablo Radicella, Didier Gasparutto, Marie-Joseph Giraud-Panis (Membre(s) du jury) ; Evelyne Sage, Juan Pablo Radicella (Rapporteur(s)) |
| Autres localisations: | Voir dans le Sudoc |
| Variante du titre: | yOgg1, a Saccharomyces cerevisiae bifunctional DNA glycosylase involved in base excision repair of oxidative DNA damage, interacts with the replicative DNA polymerase, Pol |
| LEADER | 06244nam a22003977a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | 524639 | ||
| 008 | 150423s2013 xxe ||| |||| 00| 0 fre d | ||
| 009 | PPN185151779 | ||
| 041 | 0 | |a fre |b fre |b eng | |
| 082 | |a 572.86 | ||
| 084 | |a 570 | ||
| 100 | 1 | |a Essalhi, Kadija, |d 1985- . | |
| 240 | 1 | 0 | |a yOgg1, a Saccharomyces cerevisiae bifunctional DNA glycosylase involved in base excision repair of oxidative DNA damage, interacts with the replicative DNA polymerase, Pol |
| 245 | 1 | 0 | |a Interaction entre yOgg1, une ADN glycosylase de la voie BER, et l'ADN polymérase réplicative Pol chez Saccharomyces cerevisiae |c Kadija Essalhi ; sous la direction de Bertrand Castaing. |
| 256 | |a Données textuelles | ||
| 260 | |c 2013. | ||
| 500 | |a Titre provenant de l'écran-titre | ||
| 500 | |a Ecole(s) Doctorale(s) : École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire ; 2012-....) | ||
| 500 | |a Partenaire(s) de recherche : Centre de biophysique moléculaire (Orléans ; 1967-....) (Laboratoire) | ||
| 500 | |a Autre(s) contribution(s) : Alain Legrand (Président du jury) ; Bertrand Castaing, Alain Legrand, Evelyne Sage, Juan Pablo Radicella, Didier Gasparutto, Marie-Joseph Giraud-Panis (Membre(s) du jury) ; Evelyne Sage, Juan Pablo Radicella (Rapporteur(s)) | ||
| 502 | |a Thèse de doctorat. Biologie. Biologie cellulaire et moléculaire. Orléans. 2013 | ||
| 520 | |a Les dommages oxydatifs de l ADN sont impliqués dans les processus pathologiques que sont le cancer, les maladies neurodégénératives ou le vieillissement. Ces dommages résultent en partie de l action des espèces réactives de l oxygène (ERO), qui proviennent du métabolisme cellulaire ou d agents exogènes (physiques ou chimiques), et qui conduisent à différents types de lésions parmi lesquelles l oxydation des bases de l ADN (8-oxoguanine, 8-oxoG) ou la formation de sites abasiques AP (apurique/apyrimidique). Ces lésions, qui si elles ne sont pas éliminées conduisent à des processus de mutagenèse ou de mort cellulaire, sont prises en charge spécifiquement par le système de réparation de l ADN par excision de base ou BER. Le BER est initié par l action d une ADN glycosylase, telles que la 8-oxoG-ADN glycosylase (Ogg1) chargée d éliminer la 8-oxoG, une lésion très abondante. Une étude par double-hybride initiatrice de ce projet a révélé l existence d une interaction in vivo chez S. cerevisiae entre la protéine yOgg1 et la sous-unité catalytique de l ADN polymérase réplicative Pol (yPol2), également impliquée dans la voie BER chez la levure. Nos travaux démontrent que yOgg1 et yPol2 interagissent bien physiquement entre elles et de façon spécifique. Une étude par troncations et mutagenèse dirigée nous a permis d identifier le domaine 3 ->5 exonucléase de yPol2 comme faisant partie de la forme tronquée minimale de yPol2 capable d interagir avec yOgg1. La poche du site actif de yOgg1 et/ou son voisinage immédiat pourrait contenir pour partie le site d interaction pour yPol2. Nous observons d ailleurs une corrélation nette entre l activité de yOgg1 et sa capacité à interagir avec yPol2 dans la levure. De même, l activité 3 ->5 exonucléase de yPol2 pourrait être liée à son interaction avec yOgg1. D un point de vue fonctionnel, yPol2 stimulerait l activité AP lyase de yOgg1 et le couplage entre l activité ADN glycosylase et AP lyase de l enzyme, permettant ainsi une meilleure coordination de l étape d excision du nucléoside endommagé et l étape de resynthèse de l ADN dans la voie BER. | ||
| 520 | |a Oxidative DNA damages are involved in pathological processes such as cancer, neurodegenerative diseases and aging. Part of these damages results from the action of reactive oxygen species (ROS), which are produced by cellular metabolism or (physical or chemical) exogenous agents. They lead to different types of DNA lesions including DNA base oxidation (8-oxoguanine, 8-oxoG) and abasic site formation (AP, apuric/apyrimidic). If not removed, these lesions lead to mutagenesis or cell death. Most of base lesions are dealt specifically by the base excision repair (BER) pathway. BER is initiated by a DNA glycosylase, such as 8-oxoG-DNA glycosylase (Ogg1) which is responsible for the removal of 8-oxoG. In previous unpublished work, a yeast two-hybrid study revealed the existence in S. cerevisiae of an interaction between yOgg1 and the catalytic subunit of the replicative DNA polymerase Pol (yPol2), also involved in the BER pathway in eukaryotes. Our work shows that yOgg1 and yPol2 physically and specifically interact with each other. Truncation and site-directed mutagenesis studies allowed us to identify the 3 ' -> 5' exonuclease activity domain of yPol2 as part of the minimal form of yPol2 still able to interact with yOgg1. The active site of yOgg1 and/or its immediate vicinity may contain part of its interaction domain with yPol2. Besides, we observe a clear correlation between yOgg1 catalytic activity and its ability to interact with yPol2 in vivo. Similarly, the 3'->5' exonuclease activity of yPol2 could be useful to its interaction with yOgg1. From a functional point of view, yPol2 stimulates in vitro the AP lyase activity of yOgg1 and the coupling of both DNA glycosylase and AP lyase enzyme activity. The interaction yOgg1/yPol2 could allow a better coordination of damaged nucleoside excision and DNA re-synthesis steps in BER. | ||
| 538 | |a Configuration requise : un logiciel capable de lire un fichier au format : PDF | ||
| 650 | |a ADN |x Réparation | ||
| 650 | |a ADN polymérases | ||
| 650 | |a ADN |x Réplication | ||
| 650 | |a Saccharomyces cerevisiae | ||
| 650 | |a Thèses et écrits académiques | ||
| 700 | 1 | |a Castaing, Bertrand. |4 ths |4 opn | |
| 710 | 2 | |a Université d'Orléans. |4 dgg | |
| 856 | 4 | |q PDF |s 9950842 |u http://www.theses.fr/2013ORLE2077/document |z Accès au texte intégral | |
| 856 | 4 | |u https://theses.univ-orleans.fr/public/2013ORLE2077_vm.pdf | |
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| 997 | |0 524639 |1 Thèse numérique |a Ressource numérique |b INSA |b ENSA |c 0/Bibliothèque numérique/ |c 1/Bibliothèque numérique/Autre ressource numérique/ | ||