Intermittent transport processes on surfaces

Comment les protéïnes trouvent-elles leur chemin vers les rares endroits des molécules d ADN où elles peuvent perpétuer le processus de vie ? De nombreuses études récentes tendent à prouver que seule une dynamique intermittente, c est à dire à (au moins) deux régimes permet ce processus. L objet pri...

Cijeli opis

Spremljeno u:
Bibliografski detalji
Glavni autor: Phun, Xuan Lan, 1987-
Daljnji autori: Batakis, Athanasios, 19..-...., mathématicien (Savjetnik disertacije, Protivnik), Zinsmeister, Michel, 1956-...., mathématicien (Savjetnik disertacije, Protivnik), Seuret, Stéphane, 1975- (Protivnik), Biermé, Hermine, 1979-...., mathématicienne (Protivnik), Hillairet, Luc, 1973-...., auteur en mathématiques appliquées (Protivnik), Grebenkov, Denis, 1978- (Protivnik), Bénichou, Olivier, 1972-...., physicien (Protivnik)
Format: Thèse numérique
Jezik:Anglais
Izdano: 2014.
Teme:
Online pristup:Accès au texte intégral
https://theses.univ-orleans.fr/public/2014ORLE2034_va.pdf
http://www.theses.fr/2014ORLE2034/abes
https://theses.hal.science/tel-01128041
Bilješka: Titre provenant de l'écran-titre
Ecole(s) Doctorale(s) : École doctorale Mathématiques, Informatique, Physique Théorique et Ingénierie des Systèmes (Centre-Val de Loire ; 2012-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire mathématiques - analyse, probabilités, modélisation (Orléans ; 2012-2017) (Laboratoire)
Autre(s) contribution(s) : Stéphane Seuret (Président du jury) ; Athanasios Batakis, Michel Zinsmeister, Stéphane Seuret, Hermine Biermé, Luc Hillairet, Denis Grebenkov, Olivier Bénichou (Membre(s) du jury) ; Hermine Biermé (Rapporteur(s))
Autres localisations: Voir dans le Sudoc
Variante du titre:Processus de transport intemittent sur surfaces
LEADER 05523nam a22004697a 4500
001 522042
008 150309s2014 xxe ||| |||| 00| 0 eng d
009 PPN18417810X
041 0 |a eng  |b fre  |b eng 
082 |a 510 
084 |a 510 
100 1 |a Phun, Xuan Lan,  |d 1987- . 
240 1 0 |a Processus de transport intemittent sur surfaces 
245 1 0 |a Intermittent transport processes on surfaces   |c Xuan Lan Phun ; sous la direction de Athanasios Batakis et de Michel Zinsmeister. 
256 |a Données textuelles 
260 |c 2014. 
500 |a Titre provenant de l'écran-titre 
500 |a Ecole(s) Doctorale(s) : École doctorale Mathématiques, Informatique, Physique Théorique et Ingénierie des Systèmes (Centre-Val de Loire ; 2012-....) 
500 |a Partenaire(s) de recherche : Laboratoire mathématiques - analyse, probabilités, modélisation (Orléans ; 2012-2017) (Laboratoire) 
500 |a Autre(s) contribution(s) : Stéphane Seuret (Président du jury) ; Athanasios Batakis, Michel Zinsmeister, Stéphane Seuret, Hermine Biermé, Luc Hillairet, Denis Grebenkov, Olivier Bénichou (Membre(s) du jury) ; Hermine Biermé (Rapporteur(s)) 
502 |a Thèse de doctorat. Mathématiques. Orléans. 2014 
520 |a Comment les protéïnes trouvent-elles leur chemin vers les rares endroits des molécules d ADN où elles peuvent perpétuer le processus de vie ? De nombreuses études récentes tendent à prouver que seule une dynamique intermittente, c est à dire à (au moins) deux régimes permet ce processus. L objet principal de cette thèse est une étude rigoureuse d un modèle simplifié de dynamique intermittente. Dans ce modèle la molécule alterne des dynamiques browniennes dans le "bulk" et sur la "surface" (i.e. la molécule d ADN dans l exemple plus haut) jusqu à ce qu elle atteigne sa cible, une petite fenêtre sur la surface: le temps passé par la molécule à la surface est naturellement modélisé comme une variable exponentielle de paramètre . Le principal résultat de la thèse est que quels que soient les paramètres, la recherche purement "par le bulk" n est jamais optimale, ce qui légitime la thèse de la dynamique intermittente. On y caractérise aussi le cas où le temps optimal est atteint pour > 0. L outil mathématique nouveau est l introduction d un opérateur autoadjoint et de sa base orthonormée de vecteurs propres. Cette étude permet d obtenir un développement asymptotique à grand du temps moyen d atteinte de la cible. Par ailleurs, un modèle nouveau est introduit: c est celui du tore qui porte un paramètre supplémentaire, à savoir son module. Il est montre dans cette thèse que certaines valeurs du module conduisent à prouver que la stratégie intermittente est considérablement meilleure que celle de la pure diffusion dans le bulk. 
520 |a How do proteins find their way towards the rare places on DNA molecules where they need to go in order to perpetuate the life process ? Many recent works tend to show that only an intermittent dynamics, that is a dynamics with two or more regimes, allows this process. The main goal of this PhD is a rigorous study of a simplified model of intermittent dynamics. In this model the molecule alternates diffusion in the bulk with a different kind of diffusion on the surface until it reaches its target consisting in a small window on the surface. The time spent by the molecule on the surface is naturally modeled as following an exponential law with parameter . The main result of this thesis is to show that, whatever the parameters are, a pure bulk strategy is never optimal, thus reinforcing the hypothesis of intermittent dynamics. One also characterizes the case where the optimal timed is attained for > 0. The new mathematical tool is the introduction of a self-adjoint operator and the use of its orthonormal basis of eigenvectors. This tool allows to obtain a precise asymptotic behavior of the mean exit time for large. Besides that a new geometrical model is developed, called the torus model. This new model carries a new parameter, namely its modulus. It is shown in this thesis that for some values of the modulus the optimized exit time is significantly (allowing experimental checking for instance) shorter than the pure bulk search. 
538 |a Configuration requise : un logiciel capable de lire un fichier au format : PDF 
650 |a Dynamique 
650 |a Interfaces (biologie) 
650 |a Transport biologique 
650 |a Processus de mouvement brownien 
650 |a Thèses et écrits académiques 
700 1 |a Batakis, Athanasios,  |d 19..-....,  |c mathématicien.  |4 ths  |4 opn 
700 1 |a Zinsmeister, Michel,  |d 1956-....,  |c mathématicien.  |4 ths  |4 opn 
700 1 |a Seuret, Stéphane,  |d 1975-  |4 opn 
700 1 |a Biermé, Hermine,  |d 1979-....,  |c mathématicienne.  |4 opn 
700 1 |a Hillairet, Luc,  |d 1973-....,  |c auteur en mathématiques appliquées.  |4 opn 
700 1 |a Grebenkov, Denis,  |d 1978-  |4 opn 
700 1 |a Bénichou, Olivier,  |d 1972-....,  |c physicien.  |4 opn 
710 2 |a Université d'Orléans.  |4 dgg 
856 4 |q PDF  |s 3475746  |u http://www.theses.fr/2014ORLE2034/document  |z Accès au texte intégral 
856 4 |u https://theses.univ-orleans.fr/public/2014ORLE2034_va.pdf 
856 4 |u http://www.theses.fr/2014ORLE2034/abes 
856 4 |u https://theses.hal.science/tel-01128041 
997 |0 522042  |1 Thèse numérique  |a Ressource numérique  |b INSA  |b ENSA  |c 0/Bibliothèque numérique/  |c 1/Bibliothèque numérique/Autre ressource numérique/