Stratégies de docking-scoring assistées par analyse de données : application au criblage virtuel des cibles thérapeutiques COX-2 et PPAR gamma

Le criblage virtuel est une technique permettant d extraire, d une chimiothèque donnée, des produits actifs ou affin pour une cible ou un profil pharmacologique donné. Nous avons développé une méthodologie impliquant les données tridimensionnelles des protéines COX2 et PPARg. Tout d abord, nous avon...

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Autore principale: Arrault, Alban, 1979-
Altri autori: Morin-Allory, Luc (Relatore della tesi), Marot, Christophe (Relatore della tesi)
Natura: Thèse et Mémoire papier
Lingua:Français
Pubblicazione: [S.l.] : [s.n.] 2007.
Soggetti:
Autres localisations: Voir dans le Sudoc
Variante du titre:Docking-scoring strategies assisted by data analysis :, application to virtual screening of COX-2 and PPAR gamma therapeutical targets
Edition sous un autre format:• Stratégies de docking-scoring assistées par analyse de données, application au criblage virtuel des cibles thérapeutiques COX-2 et PPAR gamma, par Alban Arrault, Villeurbanne, [CCSD], 2008
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100 1 |a Arrault, Alban,  |d 1979- 
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245 1 0 |a Stratégies de docking-scoring assistées par analyse de données :  |b application au criblage virtuel des cibles thérapeutiques COX-2 et PPAR gamma   |c par Alban Arrault ; [sous la dir. de] L. Morin-Allory,... [et de] C. Marot,... 
260 |a [S.l.] :  |b [s.n.],  |c 2007. 
300 |a 1 vol. (189 p.) :  |b ill. en noir et en coul. ;  |c 30 cm. 
502 |a Thèse de doctorat. Modélisation moléculaire et chemoinformatique. Orléans. 2007 
504 |a Glossaire 
520 |a Le criblage virtuel est une technique permettant d extraire, d une chimiothèque donnée, des produits actifs ou affin pour une cible ou un profil pharmacologique donné. Nous avons développé une méthodologie impliquant les données tridimensionnelles des protéines COX2 et PPARg. Tout d abord, nous avons comparé les différentes structures entre elles mais également les fonctions de scoring utilisées pour prédire l affinité de molécules pour ces cibles. Par ailleurs, nous avons étudié des méthodes de consensus et d analyse de données multivariée pour interpréter les fonctions de scoring. De plus, l incorporation de techniques originales au protocole de docking-scoring a été testée. Plus précisément, un modèle pharmacophore, agissant comme filtre de composés indésirables, a été évalué pour diminuer les temps de calcul mais également pour améliorer le choix de la première pose. Par ailleurs, le couplage de la dynamique moléculaire, en amont du docking, nous a permis de prendre en compte la flexibilité du site actif. Nous avons montré l utilité d une telle stratégie pour améliorer les prédictions. Enfin, nous avons appliqué les méthodes de consensus et d analyse de données multivariées (normalement employées pour les fonctions de scoring) aux données provenant des conformères issus de la dynamique moléculaire. 
650 |a Criblage pharmacologique 
650 |a Exploration de données 
650 |a Thèses et écrits académiques 
700 1 |a Morin-Allory, Luc.  |4 ths 
700 1 |a Marot, Christophe.  |4 ths 
710 2 |a Université d'Orléans.  |4 dgg 
776 0 |0 226404153  |t Stratégies de docking-scoring assistées par analyse de données  |o application au criblage virtuel des cibles thérapeutiques COX-2 et PPAR gamma  |f par Alban Arrault  |c Villeurbanne  |n [CCSD]  |d 2008 
787 0 8 |i Reproduced as:  |0 247062154  |t Stratégies de docking-scoring assistées par analyse de données  |o application au criblage virtuel des cibles thérapeutiques COX-2 et PPAR gamma  |f par Alban Arrault  |c Lille  |n Atelier national de reproduction des thèses  |d 2007  |p Microfiches  |s Lille-Thèses 
997 |0 258589  |1 Thèse et Mémoire papier  |a Ressource papier  |c 0/Orléans/  |c 1/Orléans/BU Sciences, Technologies, STAPS/  |z Orléans, BU Sciences, Technologies, STAPS, TS 19-2007-68  |z Orléans, BU Sciences, Technologies, STAPS, TS 19-2007-68 b